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DGGE法与常规培养法对稻田蓝细菌多态性分析结果比较

宋铁英 林智敏 郑伟文 L0TTAMartenss0n ULLARusmussen

宋铁英, 林智敏, 郑伟文, L0TTAMartenss0n, ULLARusmussen. DGGE法与常规培养法对稻田蓝细菌多态性分析结果比较[J]. 中国生态农业学报(中英文), 2005, 13(3): 140-143.
引用本文: 宋铁英, 林智敏, 郑伟文, L0TTAMartenss0n, ULLARusmussen. DGGE法与常规培养法对稻田蓝细菌多态性分析结果比较[J]. 中国生态农业学报(中英文), 2005, 13(3): 140-143.
SONG Tie-Ying, LIN Zhi-Min, ZHENG Wei-Wen, LOTTA Martensson, ULLA Rusmussen. Analysis on the species diversity of cyanobacteria in paddy field by comparison between norm al culture and DGGE method[J]. Chinese Journal of Eco-Agriculture, 2005, 13(3): 140-143.
Citation: SONG Tie-Ying, LIN Zhi-Min, ZHENG Wei-Wen, LOTTA Martensson, ULLA Rusmussen. Analysis on the species diversity of cyanobacteria in paddy field by comparison between norm al culture and DGGE method[J]. Chinese Journal of Eco-Agriculture, 2005, 13(3): 140-143.

DGGE法与常规培养法对稻田蓝细菌多态性分析结果比较

基金项目: 瑞典SIDA项目“蓝细菌固氮在持续水稻产量中的意义”资助

Analysis on the species diversity of cyanobacteria in paddy field by comparison between norm al culture and DGGE method

  • 摘要: 研究运用蓝细菌和硅藻16S rDNA特异引物,将晚季水稻生长后期稻田土壤中提取的总DNA进行PCR扩增后,以DGGE技术对PCR产物进行分析结果表明,14条DGGE带经克隆测序,经NCBI基因库比对得晚季水稻生长后期存在10种蓝细菌,包括4种Leptolynggbya、1种Chamaesiphon、1种Nostoc、1种Oscillatoria、2种Synechococcus和1种Chroococcidiopsis。同层不同位置土壤中蓝细菌种群亦有所不同,但每个取样点都有一些特有的蓝细菌种类。用常规方法对同一稻田土壤样品进行分离培养,根据蓝细菌鉴定图谱观察到类似L3mgbyaOscillatoriaChroococcidiopsisNostoc的蓝细菌,但显微镜下无法准确分类。比较结果表明采用DGGE法比常规培养法能更准确进行蓝细菌多态性鉴定。
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出版历程
  • 收稿日期:  2004-11-12
  • 修回日期:  2004-12-01
  • 刊出日期:  2005-09-26

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